Hiện nay, Ga Hà Nội có 2 khu vực, toạ lạc tại 2 quận khác nhau ở Thủ đô: Khu A: Số 120 Lê Duẩn, quận Hoàn Kiếm Khu B: Số 1 Trần Quý Cáp, phường Văn Miếu, quận Đống Đa